Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4930507D05RikQ8C9C9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms