Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc159Q8C963 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc159Q8C963 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms