Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C5C9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms