Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms