Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SowahcQ8C0J6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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