Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pggt1bQ8BUY9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pggt1bQ8BUY9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms