Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp43Q8BUM9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms