Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E330017A01RikQ8BU47 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E330017A01RikQ8BU47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms