Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV1

Tusc3, Tumor suppressor candidate 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc3Q8BTV1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tusc3Q8BTV1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms