Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3Q8BRE0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms