Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms