Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms