Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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