Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms