Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BGC1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms