Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Htatsf1Q8BGC0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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