Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cpped1Q8BFS6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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