Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc50Q810U5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms