Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Lrfn4Q80XU8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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