Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms