Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms