Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms