Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps6ka6Q7TPS0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms