Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stk40Q7TNL3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms