Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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