Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcl2Q78Y63 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms