Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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