Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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