Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv1Q704Y3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms