Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms