Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms