Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms