Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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