Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms