Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrimpolQ6P1E7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms