Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krba1Q6NXZ1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms