Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Papd5Q68ED3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms