Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80dQ66JY2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms