Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc18Q640L5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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