Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift52Q62559 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms