Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a2Q62148 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms