Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ecm1Q61508 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms