Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn18Q61152 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn18Q61152 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn18Q61152 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn18Q61152 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn18Q61152 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ptpn18Q61152 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ptpn18Q61152 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn18Q61152 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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