Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nab1Q61122 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms