Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf1Q61069 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf1Q61069 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf1Q61069 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf1Q61069 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usf1Q61069 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usf1Q61069 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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