Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
JrkQ60976 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JrkQ60976 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms