Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms