Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stxbp3Q60770 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms