Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms