Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms